32. Spieltag
16.05.2000	SV Darmstadt 98	SV Wehen	0:0 (0:0)
16.05.2000	Wacker Burghausen	VfR Aalen	2:0 (1:0)
16.05.2000	Karlsruher SC II	1. FC Schweinfurt 05	1:2 (1:0)
17.05.2000	FSV Frankfurt	Bayern München II	2:3 (1:2)
17.05.2000	Quelle Fürth	TSF Ditzingen	1:0 (0:0)
17.05.2000	SSV Reutlingen 05	VfB Stuttgart II	2:0 (1:0)
17.05.2000	1860 München II	Borussia Fulda	2:1 (1:0)
17.05.2000	SC Pfullendorf	SV Lohhof	2:1 (2:0)
17.05.2000	VfR Mannheim	FC Augsburg	0:1 (0:1)

			Gesamt
Pl.	Pl.	Verein	Sp.	Ge	Un	Ve	Tore	Diff	Pkte
1.	(1)	SSV Reutlingen 05	32	26	3	3	93:22	71	81
2.	(2)	SC Pfullendorf	32	18	7	7	57:33	24	61
3.	(3)	VfR Mannheim	32	14	11	7	58:53	5	53
4.	(4)	Wacker Burghausen	32	14	10	8	51:39	12	52
5.	(6)	1860 München II	32	12	12	8	48:36	12	48
6.	(5)	VfB Stuttgart II	32	11	13	8	49:34	15	46
7.	(8)	Bayern München II	32	13	6	13	60:58	2	45
8.	(9)	FC Augsburg	32	12	9	11	41:39	2	45
9.	(7)	Karlsruher SC II	32	11	11	10	55:48	7	44
10.	(10)	SV Darmstadt 98 (N)	32	10	13	9	43:45	-2	43
11.	(11)	FSV Frankfurt	32	10	11	11	48:52	-4	41
12.	(12)	VfR Aalen (N)	32	10	10	12	49:54	-5	40
13.	(14)	1. FC Schweinfurt 05	32	12	3	17	42:52	-10	39
14.	(13)	SV Wehen	32	9	10	13	41:50	-9	37
15.	(15)	Quelle Fürth (N)	32	8	11	13	37:61	-24	35
16.	(16)	TSF Ditzingen	32	6	12	14	40:53	-13	30
17.	(17)	Borussia Fulda	32	6	12	14	38:54	-16	30
18.	(18)	SV Lohhof (N)	32	2	4	26	27:94	-67	10

Der Tabellenerste steigt direkt in die 2. Bundesliga auf, der Zweite kommt in die Aufstiegsrunde. Bis Rang elf qualifizieren sich die Teams für die zweigleisige Regionalliga. Der Tabellenzwölfte muss in die Relegation.
Der FC Augsburg erhält keine Regionalliga-Lizenz für die Saison 2000/01 und steht damit als Absteiger fest. Die 2. Mannschaft des Karlsruher SC muss wegen des Zweitligaabstiegs des KSC in die Oberliga.
Die Partie FSV Frankfurt - VfB Stuttgart Am. (34. Spieltag; 1:0) wurde mit 0:2 gewertet, da Frankfurt einen nicht auf dem Spielberichtsbogen aufgelisteten Akteur eingesetzt hatte.

|Heimtabelle|Auswärtstabelle|Vorrunde|Rückrunde|vorheriger Spieltag|nächster Spieltag|alle Ergebnisse|Statistik|

33. Spieltag
20.05.2000	1. FC Schweinfurt 05	1860 München II	1:0 (0:0)
21.05.2000	SSV Reutlingen 05	FSV Frankfurt	3:0 (2:0)
21.05.2000	Borussia Fulda	FC Augsburg	0:0
21.05.2000	VfR Aalen	Karlsruher SC II	1:0 (0:0)
21.05.2000	SV Wehen	Wacker Burghausen	3:1 (1:1)
21.05.2000	SV Lohhof	SV Darmstadt 98	2:4 (0:2)
21.05.2000	TSF Ditzingen	SC Pfullendorf	2:0 (0:0)
21.05.2000	Bayern München II	Quelle Fürth	3:0 (1:0)
21.05.2000	VfB Stuttgart II	VfR Mannheim	0:0

34. Spieltag
27.05.2000	VfR Mannheim	Borussia Fulda	3:2 (1:1)
27.05.2000	Quelle Fürth	SSV Reutlingen 05	3:6 (2:4)
27.05.2000	SC Pfullendorf	Bayern München II	0:1 (0:0)
27.05.2000	SV Darmstadt 98	TSF Ditzingen	2:4 (1:1)
27.05.2000	Wacker Burghausen	SV Lohhof	5:0 (2:0)
27.05.2000	Karlsruher SC II	SV Wehen	1:2 (0:1)
27.05.2000	1860 München II	VfR Aalen	0:1 (0:0)
27.05.2000	FC Augsburg	1. FC Schweinfurt 05	2:4 (1:0)
27.05.2000	FSV Frankfurt	VfB Stuttgart II	0:2 W